Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSNK1DP48730 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1DP48730 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms