Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
NPTX2P47972 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPTX2P47972 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms