Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPDA1P46926 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms