Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRCC3P46736 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRCC3P46736 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms