Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX2-1P43699 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms