Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MAGEA1P43355 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms