Protein–RNA interactions for Protein: P42830

CXCL5, C-X-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL5P42830 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL5P42830 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms