Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH1P40692 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MLH1P40692 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH1P40692 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH1P40692 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH1P40692 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH1P40692 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH1P40692 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLH1P40692 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH1P40692 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH1P40692 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH1P40692 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH1P40692 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH1P40692 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH1P40692 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLH1P40692 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MLH1P40692 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MLH1P40692 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MLH1P40692 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MLH1P40692 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MLH1P40692 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MLH1P40692 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MLH1P40692 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MLH1P40692 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MLH1P40692 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MLH1P40692 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH1P40692 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH1P40692 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH1P40692 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH1P40692 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH1P40692 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH1P40692 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH1P40692 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH1P40692 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH1P40692 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH1P40692 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLH1P40692 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH1P40692 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH1P40692 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH1P40692 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH1P40692 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MLH1P40692 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH1P40692 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH1P40692 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH1P40692 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH1P40692 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH1P40692 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH1P40692 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLH1P40692 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH1P40692 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH1P40692 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH1P40692 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH1P40692 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH1P40692 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH1P40692 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH1P40692 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLH1P40692 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH1P40692 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH1P40692 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH1P40692 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH1P40692 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH1P40692 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH1P40692 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH1P40692 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH1P40692 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH1P40692 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH1P40692 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH1P40692 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH1P40692 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH1P40692 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH1P40692 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH1P40692 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH1P40692 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLH1P40692 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH1P40692 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH1P40692 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH1P40692 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH1P40692 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH1P40692 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH1P40692 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLH1P40692 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH1P40692 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH1P40692 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH1P40692 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH1P40692 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH1P40692 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH1P40692 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLH1P40692 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH1P40692 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH1P40692 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH1P40692 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH1P40692 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH1P40692 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLH1P40692 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLH1P40692 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLH1P40692 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLH1P40692 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MLH1P40692 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLH1P40692 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLH1P40692 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142 ms