Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARL1P40616 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARL1P40616 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARL1P40616 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARL1P40616 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARL1P40616 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARL1P40616 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARL1P40616 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARL1P40616 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARL1P40616 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARL1P40616 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARL1P40616 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARL1P40616 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARL1P40616 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARL1P40616 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARL1P40616 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARL1P40616 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARL1P40616 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARL1P40616 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARL1P40616 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARL1P40616 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARL1P40616 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARL1P40616 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL1P40616 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL1P40616 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL1P40616 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL1P40616 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL1P40616 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL1P40616 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL1P40616 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL1P40616 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL1P40616 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL1P40616 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL1P40616 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL1P40616 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL1P40616 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL1P40616 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL1P40616 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL1P40616 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL1P40616 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL1P40616 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL1P40616 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL1P40616 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL1P40616 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL1P40616 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL1P40616 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL1P40616 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL1P40616 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL1P40616 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL1P40616 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL1P40616 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL1P40616 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL1P40616 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL1P40616 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL1P40616 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL1P40616 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL1P40616 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL1P40616 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL1P40616 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL1P40616 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL1P40616 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL1P40616 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL1P40616 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL1P40616 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL1P40616 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL1P40616 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL1P40616 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL1P40616 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL1P40616 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL1P40616 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL1P40616 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL1P40616 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL1P40616 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL1P40616 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL1P40616 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL1P40616 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL1P40616 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL1P40616 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL1P40616 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARL1P40616 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARL1P40616 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL1P40616 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL1P40616 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL1P40616 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL1P40616 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL1P40616 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL1P40616 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL1P40616 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL1P40616 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL1P40616 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL1P40616 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL1P40616 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL1P40616 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL1P40616 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL1P40616 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL1P40616 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL1P40616 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL1P40616 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL1P40616 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL1P40616 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms