Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNA3P32297 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms