Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
L1CAMP32004 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
L1CAMP32004 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms