Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA5P31644 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms