Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSPOP30536 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSPOP30536 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSPOP30536 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSPOP30536 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSPOP30536 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSPOP30536 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSPOP30536 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TSPOP30536 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSPOP30536 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TSPOP30536 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPOP30536 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPOP30536 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPOP30536 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPOP30536 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPOP30536 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPOP30536 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPOP30536 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPOP30536 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPOP30536 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPOP30536 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPOP30536 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPOP30536 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSPOP30536 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSPOP30536 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSPOP30536 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSPOP30536 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TSPOP30536 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSPOP30536 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TSPOP30536 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSPOP30536 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSPOP30536 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSPOP30536 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSPOP30536 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSPOP30536 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSPOP30536 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPOP30536 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPOP30536 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPOP30536 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPOP30536 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPOP30536 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPOP30536 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPOP30536 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPOP30536 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPOP30536 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPOP30536 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPOP30536 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPOP30536 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPOP30536 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPOP30536 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPOP30536 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPOP30536 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPOP30536 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPOP30536 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPOP30536 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPOP30536 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPOP30536 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPOP30536 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPOP30536 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPOP30536 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPOP30536 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPOP30536 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPOP30536 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPOP30536 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPOP30536 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPOP30536 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPOP30536 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPOP30536 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPOP30536 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPOP30536 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPOP30536 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPOP30536 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPOP30536 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPOP30536 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPOP30536 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPOP30536 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPOP30536 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPOP30536 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPOP30536 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPOP30536 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPOP30536 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPOP30536 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPOP30536 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPOP30536 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPOP30536 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPOP30536 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPOP30536 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPOP30536 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPOP30536 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPOP30536 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPOP30536 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPOP30536 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPOP30536 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPOP30536 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPOP30536 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPOP30536 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPOP30536 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPOP30536 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TSPOP30536 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TSPOP30536 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms