Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCSK1P29120 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCSK1P29120 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms