Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E2P29084 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms