Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFS1P28331 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NDUFS1P28331 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFS1P28331 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms