Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms