Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARK3P27448 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARK3P27448 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARK3P27448 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARK3P27448 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARK3P27448 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MARK3P27448 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARK3P27448 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARK3P27448 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARK3P27448 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARK3P27448 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARK3P27448 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARK3P27448 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MARK3P27448 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARK3P27448 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARK3P27448 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARK3P27448 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARK3P27448 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARK3P27448 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARK3P27448 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MARK3P27448 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MARK3P27448 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARK3P27448 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARK3P27448 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MARK3P27448 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MARK3P27448 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARK3P27448 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARK3P27448 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARK3P27448 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARK3P27448 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARK3P27448 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARK3P27448 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MARK3P27448 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARK3P27448 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARK3P27448 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MARK3P27448 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARK3P27448 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARK3P27448 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARK3P27448 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MARK3P27448 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARK3P27448 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MARK3P27448 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MARK3P27448 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARK3P27448 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARK3P27448 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARK3P27448 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARK3P27448 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARK3P27448 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MARK3P27448 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARK3P27448 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARK3P27448 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARK3P27448 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARK3P27448 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARK3P27448 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MARK3P27448 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARK3P27448 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARK3P27448 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARK3P27448 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARK3P27448 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARK3P27448 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARK3P27448 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARK3P27448 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARK3P27448 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARK3P27448 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARK3P27448 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARK3P27448 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARK3P27448 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARK3P27448 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARK3P27448 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARK3P27448 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARK3P27448 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARK3P27448 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARK3P27448 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARK3P27448 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARK3P27448 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARK3P27448 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARK3P27448 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARK3P27448 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARK3P27448 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARK3P27448 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARK3P27448 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MARK3P27448 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARK3P27448 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARK3P27448 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARK3P27448 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARK3P27448 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARK3P27448 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARK3P27448 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARK3P27448 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MARK3P27448 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARK3P27448 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARK3P27448 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARK3P27448 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARK3P27448 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARK3P27448 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARK3P27448 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARK3P27448 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MARK3P27448 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARK3P27448 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARK3P27448 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms