Protein–RNA interactions for Protein: P25440

BRD2, Bromodomain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD2P25440 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRD2P25440 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRD2P25440 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRD2P25440 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRD2P25440 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD2P25440 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD2P25440 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD2P25440 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD2P25440 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD2P25440 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD2P25440 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD2P25440 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD2P25440 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD2P25440 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD2P25440 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD2P25440 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD2P25440 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD2P25440 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD2P25440 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD2P25440 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD2P25440 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD2P25440 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD2P25440 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD2P25440 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD2P25440 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD2P25440 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD2P25440 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD2P25440 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD2P25440 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD2P25440 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD2P25440 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD2P25440 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD2P25440 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD2P25440 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD2P25440 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD2P25440 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD2P25440 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD2P25440 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD2P25440 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD2P25440 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD2P25440 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD2P25440 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD2P25440 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD2P25440 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD2P25440 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD2P25440 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD2P25440 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD2P25440 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD2P25440 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD2P25440 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD2P25440 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD2P25440 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD2P25440 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD2P25440 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD2P25440 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD2P25440 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD2P25440 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD2P25440 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD2P25440 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD2P25440 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD2P25440 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD2P25440 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD2P25440 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD2P25440 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD2P25440 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD2P25440 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRD2P25440 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRD2P25440 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD2P25440 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD2P25440 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD2P25440 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD2P25440 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD2P25440 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD2P25440 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD2P25440 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD2P25440 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD2P25440 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD2P25440 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD2P25440 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD2P25440 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD2P25440 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD2P25440 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD2P25440 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD2P25440 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD2P25440 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD2P25440 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD2P25440 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD2P25440 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD2P25440 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD2P25440 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD2P25440 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD2P25440 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD2P25440 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD2P25440 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD2P25440 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD2P25440 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD2P25440 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD2P25440 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD2P25440 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD2P25440 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms