Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SP100P23497 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SP100P23497 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP100P23497 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP100P23497 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP100P23497 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP100P23497 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP100P23497 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP100P23497 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP100P23497 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP100P23497 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SP100P23497 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP100P23497 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP100P23497 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP100P23497 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP100P23497 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP100P23497 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP100P23497 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP100P23497 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP100P23497 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP100P23497 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP100P23497 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP100P23497 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP100P23497 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP100P23497 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP100P23497 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP100P23497 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP100P23497 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP100P23497 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP100P23497 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP100P23497 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP100P23497 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP100P23497 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP100P23497 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP100P23497 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP100P23497 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP100P23497 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP100P23497 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP100P23497 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP100P23497 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SP100P23497 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SP100P23497 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SP100P23497 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SP100P23497 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SP100P23497 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP100P23497 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP100P23497 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP100P23497 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP100P23497 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP100P23497 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP100P23497 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP100P23497 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SP100P23497 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP100P23497 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP100P23497 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP100P23497 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP100P23497 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP100P23497 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP100P23497 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP100P23497 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP100P23497 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP100P23497 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP100P23497 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SP100P23497 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SP100P23497 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SP100P23497 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SP100P23497 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SP100P23497 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SP100P23497 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SP100P23497 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SP100P23497 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SP100P23497 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP100P23497 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP100P23497 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP100P23497 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SP100P23497 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP100P23497 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP100P23497 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP100P23497 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP100P23497 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP100P23497 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP100P23497 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP100P23497 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP100P23497 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP100P23497 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SP100P23497 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SP100P23497 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SP100P23497 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SP100P23497 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SP100P23497 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP100P23497 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP100P23497 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP100P23497 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SP100P23497 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP100P23497 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SP100P23497 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP100P23497 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP100P23497 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SP100P23497 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SP100P23497 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.7 ms