Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.043e-9■■■■■ 33.5
RPS3P23396 CTSD-206ENST00000497544 783 ntTSL 219.71■□□□□ 0.753e-25■■■■■ 33.5
RPS3P23396 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91e-7■■■■■ 33.5
RPS3P23396 ATP5C1-210ENST00000493053 1096 ntTSL 515.74■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 33.5
RPS3P23396 ATP5C1-206ENST00000465936 292 ntTSL 315.54■□□□□ 0.081e-7■■■■■ 33.5
RPS3P23396 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 33.5
RPS3P23396 AC068580.4-202ENST00000636579 350 ntTSL 314.69□□□□□ -0.067e-22■■■■■ 33.5
RPS3P23396 ANXA6-204ENST00000517677 795 ntTSL 513.57□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 33.4
RPS3P23396 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.822e-30■■■■■ 33.4
RPS3P23396 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 33.4
RPS3P23396 RPS29-207ENST00000557367 499 ntTSL 212.94□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 33.4
RPS3P23396 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.291e-7■■■■■ 33.4
RPS3P23396 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.371e-7■■■■■ 33.4
RPS3P23396 HP-216ENST00000570083 1270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 33.4
RPS3P23396 HP-203ENST00000357763 1482 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 33.4
RPS3P23396 HP-202ENST00000355906 1443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.732e-7■■■■■ 33.4
RPS3P23396 HP-209ENST00000565574 1187 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.742e-7■■■■■ 33.4
RPS3P23396 HP-201ENST00000228226 960 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 33.4
RPS3P23396 HP-218ENST00000613898 1107 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.822e-7■■■■■ 33.4
RPS3P23396 HP-204ENST00000398131 1252 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 33.4
RPS3P23396 HP-207ENST00000562526 685 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 33.4
RPS3P23396 HP-211ENST00000566821 3024 ntTSL 26.74□□□□□ -1.332e-7■■■■■ 33.4
RPS3P23396 CTSD-209ENST00000637158 1200 ntTSL 517.37■□□□□ 0.372e-22■■■■■ 33.4
RPS3P23396 TSN-211ENST00000498545 1118 ntTSL 1 (best)14.74□□□□□ -0.057e-8■■■■■ 33.4
RPS3P23396 TSN-208ENST00000490104 2717 ntTSL 213.69□□□□□ -0.227e-8■■■■■ 33.4
RPS3P23396 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.277e-8■■■■■ 33.4
RPS3P23396 TSN-204ENST00000467324 2843 ntTSL 512.91□□□□□ -0.347e-8■■■■■ 33.4
RPS3P23396 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.397e-8■■■■■ 33.4
RPS3P23396 TSN-202ENST00000409193 1436 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.547e-8■■■■■ 33.4
RPS3P23396 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.384e-7■■■■■ 33.4
RPS3P23396 COX7B-201ENST00000373335 497 ntTSL 21.41□□□□□ -2.184e-7■■■■■ 33.4
RPS3P23396 CTSD-214ENST00000637937 1262 ntTSL 516.4■□□□□ 0.223e-22■■■■■ 33.4
RPS3P23396 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 33.3
RPS3P23396 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.582e-7■■■■■ 33.3
RPS3P23396 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -02e-7■■■■■ 33.3
RPS3P23396 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 33.3
RPS3P23396 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 33.3
RPS3P23396 SLC25A3-214ENST00000551123 1417 ntTSL 1 (best)12.2□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 33.3
RPS3P23396 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 33.3
RPS3P23396 SLC25A3-203ENST00000401722 6087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 33.3
RPS3P23396 SLC25A3-204ENST00000546766 3236 ntTSL 1 (best)10.15□□□□□ -0.782e-7■■■■■ 33.3
RPS3P23396 AC068580.4-204ENST00000427721 1007 ntTSL 215.58■□□□□ 0.083e-22■■■■■ 33.3
RPS3P23396 SERPINC1-203ENST00000494024 669 ntTSL 36.58□□□□□ -1.361e-9■■■■■ 33.3
RPS3P23396 PNP-208ENST00000557229 992 ntTSL 1 (best)12.12□□□□□ -0.472e-10■■■■■ 33.3
RPS3P23396 PNP-203ENST00000553591 770 ntTSL 56.55□□□□□ -1.362e-10■■■■■ 33.3
RPS3P23396 HP-205ENST00000561927 822 ntTSL 210.83□□□□□ -0.683e-7■■■■■ 33.2
RPS3P23396 VAT1-206ENST00000589709 570 ntTSL 411.76□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 33.2
RPS3P23396 FARSA-204ENST00000586280 803 ntTSL 312.9□□□□□ -0.345e-7■■■■■ 33.2
RPS3P23396 PSMA5-203ENST00000484563 1503 ntTSL 215.98■□□□□ 0.153e-8■■■■■ 33.2
RPS3P23396 RPA2-205ENST00000444045 682 ntTSL 514.7□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.762e-9■■■■■ 33.2
RPS3P23396 CNPY2-208ENST00000551286 484 ntTSL 516.75■□□□□ 0.272e-9■■■■■ 33.2
RPS3P23396 CNPY2-202ENST00000546388 670 ntTSL 1 (best)16.21■□□□□ 0.192e-9■■■■■ 33.2
RPS3P23396 IRX3-203ENST00000558180 1540 ntTSL 428.35■■■□□ 2.138e-12■■■■■ 33.2
RPS3P23396 FAM57A-206ENST00000574327 852 ntTSL 327.7■■■□□ 2.022e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 TOR1B-203ENST00000486372 663 ntTSL 225.04■■□□□ 1.62e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 ZDHHC24-204ENST00000534073 1615 ntTSL 323.59■■□□□ 1.372e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.192e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.172e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.112e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 CDHR2-205ENST00000510124 575 ntTSL 521.23■□□□□ 0.992e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 EMILIN1-202ENST00000433140 1431 ntTSL 219.86■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.778e-12■■■■■ 33.2
RPS3P23396 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 ZDHHC24-202ENST00000525925 907 ntTSL 319.71■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 CPT1A-207ENST00000561996 559 ntTSL 417.92■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 HES1-202ENST00000476918 1009 ntTSL 217.86■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 ARAP1-221ENST00000546293 702 ntTSL 317.39■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 OBSL1-215ENST00000604031 1774 ntTSL 216.09■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 TOR1B-202ENST00000427860 702 ntTSL 315.92■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 TYSND1-203ENST00000479086 2620 ntTSL 215.5■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 ARAP1-218ENST00000543868 507 ntTSL 215.36■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 ABCC1-207ENST00000575422 1198 ntTSL 515.21■□□□□ 0.038e-12■■■■■ 33.2
RPS3P23396 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.023e-8■■■■■ 33.2
RPS3P23396 PNPO-208ENST00000585320 503 ntTSL 314.66□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 RHBDF2-207ENST00000590168 2665 ntTSL 1 (best)14.6□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 ARAP1-216ENST00000542596 699 ntTSL 514.39□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 ALDOC-209ENST00000584086 686 ntTSL 313.79□□□□□ -0.23e-20■■■■■ 33.2
RPS3P23396 ARAP1-220ENST00000544958 473 ntTSL 313.78□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 ALDOC-205ENST00000460201 922 ntTSL 213.77□□□□□ -0.213e-20■■■■■ 33.2
RPS3P23396 ARAP1-211ENST00000495878 2758 ntTSL 1 (best)12.83□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 ALDOC-208ENST00000582381 571 ntTSL 212.8□□□□□ -0.369e-22■■■■■ 33.2
RPS3P23396 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 SLC37A4-208ENST00000526275 2626 ntTSL 1 (best)11.73□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 ALDOC-207ENST00000581807 580 ntTSL 311.33□□□□□ -0.63e-20■■■■■ 33.2
RPS3P23396 SERPINA2-201ENST00000553483 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 RHBDF2-201ENST00000313080 3582 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 ATP6V1F-202ENST00000492758 711 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.653e-8■■■■■ 33.2
RPS3P23396 RHBDF2-215ENST00000591885 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 ALDOC-206ENST00000578590 839 ntTSL 410.7□□□□□ -0.71e-21■■■■■ 33.2
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