Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCB4P21439 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB4P21439 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms