Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK11BP21127 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK11BP21127 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms