Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN3P20807 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms