Protein–RNA interactions for Protein: P19484

TFEB, Transcription factor EB, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFEBP19484 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFEBP19484 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFEBP19484 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFEBP19484 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFEBP19484 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFEBP19484 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFEBP19484 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TFEBP19484 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFEBP19484 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFEBP19484 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFEBP19484 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFEBP19484 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFEBP19484 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFEBP19484 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFEBP19484 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFEBP19484 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFEBP19484 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFEBP19484 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFEBP19484 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFEBP19484 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFEBP19484 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFEBP19484 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFEBP19484 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFEBP19484 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFEBP19484 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFEBP19484 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFEBP19484 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFEBP19484 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TFEBP19484 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFEBP19484 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFEBP19484 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TFEBP19484 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFEBP19484 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFEBP19484 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TFEBP19484 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TFEBP19484 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFEBP19484 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFEBP19484 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFEBP19484 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFEBP19484 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFEBP19484 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFEBP19484 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFEBP19484 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFEBP19484 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFEBP19484 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFEBP19484 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TFEBP19484 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFEBP19484 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFEBP19484 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFEBP19484 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFEBP19484 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFEBP19484 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFEBP19484 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFEBP19484 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFEBP19484 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFEBP19484 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFEBP19484 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFEBP19484 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFEBP19484 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFEBP19484 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFEBP19484 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFEBP19484 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFEBP19484 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFEBP19484 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFEBP19484 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TFEBP19484 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFEBP19484 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFEBP19484 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFEBP19484 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFEBP19484 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFEBP19484 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFEBP19484 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFEBP19484 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFEBP19484 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFEBP19484 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFEBP19484 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFEBP19484 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFEBP19484 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFEBP19484 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFEBP19484 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFEBP19484 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFEBP19484 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFEBP19484 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFEBP19484 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFEBP19484 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFEBP19484 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFEBP19484 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFEBP19484 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TFEBP19484 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFEBP19484 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFEBP19484 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFEBP19484 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFEBP19484 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFEBP19484 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFEBP19484 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFEBP19484 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFEBP19484 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFEBP19484 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFEBP19484 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFEBP19484 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms