Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAM1P18669 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms