Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF7P17544 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF7P17544 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF7P17544 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF7P17544 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF7P17544 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF7P17544 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF7P17544 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF7P17544 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF7P17544 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF7P17544 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF7P17544 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF7P17544 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF7P17544 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF7P17544 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF7P17544 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF7P17544 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF7P17544 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF7P17544 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF7P17544 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF7P17544 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF7P17544 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF7P17544 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF7P17544 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF7P17544 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF7P17544 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF7P17544 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF7P17544 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF7P17544 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF7P17544 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF7P17544 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF7P17544 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF7P17544 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF7P17544 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF7P17544 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF7P17544 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF7P17544 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF7P17544 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF7P17544 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF7P17544 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF7P17544 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF7P17544 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF7P17544 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF7P17544 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF7P17544 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF7P17544 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF7P17544 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF7P17544 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF7P17544 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF7P17544 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF7P17544 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF7P17544 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF7P17544 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF7P17544 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF7P17544 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF7P17544 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF7P17544 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF7P17544 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF7P17544 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF7P17544 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF7P17544 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF7P17544 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF7P17544 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF7P17544 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF7P17544 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF7P17544 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF7P17544 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF7P17544 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF7P17544 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF7P17544 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF7P17544 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF7P17544 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF7P17544 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF7P17544 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF7P17544 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF7P17544 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF7P17544 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF7P17544 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF7P17544 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF7P17544 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF7P17544 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF7P17544 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF7P17544 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF7P17544 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF7P17544 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF7P17544 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF7P17544 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF7P17544 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF7P17544 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF7P17544 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF7P17544 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF7P17544 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF7P17544 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF7P17544 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF7P17544 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF7P17544 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF7P17544 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF7P17544 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF7P17544 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF7P17544 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms