Protein–RNA interactions for Protein: P17213

BPI, Bactericidal permeability-increasing protein, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIP17213 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIP17213 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIP17213 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIP17213 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIP17213 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIP17213 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIP17213 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIP17213 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIP17213 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIP17213 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIP17213 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIP17213 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIP17213 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIP17213 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIP17213 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIP17213 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIP17213 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIP17213 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIP17213 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIP17213 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIP17213 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIP17213 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIP17213 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIP17213 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIP17213 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIP17213 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIP17213 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIP17213 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIP17213 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIP17213 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIP17213 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIP17213 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIP17213 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIP17213 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIP17213 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIP17213 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIP17213 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIP17213 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIP17213 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIP17213 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIP17213 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIP17213 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIP17213 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIP17213 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIP17213 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIP17213 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIP17213 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIP17213 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIP17213 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIP17213 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIP17213 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIP17213 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIP17213 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIP17213 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIP17213 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIP17213 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIP17213 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIP17213 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIP17213 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIP17213 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIP17213 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIP17213 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIP17213 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIP17213 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIP17213 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIP17213 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIP17213 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIP17213 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIP17213 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIP17213 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIP17213 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIP17213 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIP17213 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIP17213 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIP17213 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIP17213 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIP17213 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIP17213 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIP17213 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIP17213 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIP17213 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIP17213 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIP17213 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIP17213 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIP17213 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIP17213 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIP17213 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIP17213 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIP17213 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIP17213 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIP17213 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIP17213 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIP17213 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIP17213 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIP17213 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIP17213 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIP17213 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIP17213 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIP17213 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIP17213 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms