Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms