Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF2P15336 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF2P15336 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF2P15336 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF2P15336 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF2P15336 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF2P15336 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF2P15336 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF2P15336 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF2P15336 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF2P15336 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF2P15336 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF2P15336 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF2P15336 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF2P15336 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF2P15336 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF2P15336 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF2P15336 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF2P15336 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF2P15336 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF2P15336 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF2P15336 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF2P15336 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF2P15336 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF2P15336 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF2P15336 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF2P15336 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF2P15336 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF2P15336 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF2P15336 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF2P15336 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF2P15336 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF2P15336 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF2P15336 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF2P15336 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF2P15336 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF2P15336 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF2P15336 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF2P15336 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF2P15336 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF2P15336 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF2P15336 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF2P15336 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF2P15336 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF2P15336 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF2P15336 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF2P15336 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF2P15336 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF2P15336 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF2P15336 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF2P15336 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF2P15336 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF2P15336 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF2P15336 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF2P15336 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF2P15336 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF2P15336 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF2P15336 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF2P15336 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF2P15336 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF2P15336 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF2P15336 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF2P15336 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF2P15336 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF2P15336 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF2P15336 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF2P15336 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF2P15336 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF2P15336 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF2P15336 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF2P15336 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF2P15336 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF2P15336 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF2P15336 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF2P15336 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF2P15336 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF2P15336 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF2P15336 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF2P15336 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF2P15336 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF2P15336 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF2P15336 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF2P15336 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF2P15336 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF2P15336 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF2P15336 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF2P15336 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF2P15336 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF2P15336 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF2P15336 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF2P15336 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF2P15336 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF2P15336 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF2P15336 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF2P15336 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF2P15336 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF2P15336 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF2P15336 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF2P15336 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF2P15336 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms