Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXB3P14651 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms