Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-EP13747 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-EP13747 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-EP13747 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms