Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX6A1P12074 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX6A1P12074 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX6A1P12074 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COX6A1P12074 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COX6A1P12074 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX6A1P12074 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX6A1P12074 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX6A1P12074 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX6A1P12074 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX6A1P12074 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX6A1P12074 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX6A1P12074 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX6A1P12074 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX6A1P12074 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX6A1P12074 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
COX6A1P12074 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX6A1P12074 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
COX6A1P12074 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
COX6A1P12074 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
COX6A1P12074 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COX6A1P12074 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
COX6A1P12074 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
COX6A1P12074 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
COX6A1P12074 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
COX6A1P12074 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COX6A1P12074 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COX6A1P12074 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COX6A1P12074 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COX6A1P12074 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
COX6A1P12074 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COX6A1P12074 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COX6A1P12074 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COX6A1P12074 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COX6A1P12074 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COX6A1P12074 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
COX6A1P12074 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21■□□□□ 0.95
COX6A1P12074 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COX6A1P12074 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
COX6A1P12074 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
COX6A1P12074 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21■□□□□ 0.95
COX6A1P12074 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COX6A1P12074 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2320.3 ms