Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HKR1P10072 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HKR1P10072 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HKR1P10072 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HKR1P10072 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HKR1P10072 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HKR1P10072 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HKR1P10072 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HKR1P10072 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HKR1P10072 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HKR1P10072 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HKR1P10072 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HKR1P10072 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HKR1P10072 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HKR1P10072 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HKR1P10072 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HKR1P10072 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HKR1P10072 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HKR1P10072 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HKR1P10072 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HKR1P10072 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HKR1P10072 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HKR1P10072 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HKR1P10072 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HKR1P10072 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HKR1P10072 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HKR1P10072 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HKR1P10072 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HKR1P10072 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HKR1P10072 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HKR1P10072 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HKR1P10072 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HKR1P10072 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HKR1P10072 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HKR1P10072 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HKR1P10072 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HKR1P10072 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HKR1P10072 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HKR1P10072 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HKR1P10072 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HKR1P10072 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HKR1P10072 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HKR1P10072 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HKR1P10072 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HKR1P10072 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HKR1P10072 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HKR1P10072 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HKR1P10072 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HKR1P10072 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HKR1P10072 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HKR1P10072 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HKR1P10072 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HKR1P10072 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HKR1P10072 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HKR1P10072 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HKR1P10072 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HKR1P10072 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HKR1P10072 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HKR1P10072 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HKR1P10072 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HKR1P10072 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HKR1P10072 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HKR1P10072 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HKR1P10072 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HKR1P10072 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HKR1P10072 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HKR1P10072 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HKR1P10072 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HKR1P10072 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HKR1P10072 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HKR1P10072 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HKR1P10072 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HKR1P10072 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HKR1P10072 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HKR1P10072 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HKR1P10072 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HKR1P10072 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HKR1P10072 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HKR1P10072 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HKR1P10072 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HKR1P10072 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HKR1P10072 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HKR1P10072 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HKR1P10072 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HKR1P10072 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HKR1P10072 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HKR1P10072 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HKR1P10072 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HKR1P10072 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HKR1P10072 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HKR1P10072 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HKR1P10072 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HKR1P10072 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HKR1P10072 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HKR1P10072 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HKR1P10072 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HKR1P10072 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HKR1P10072 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HKR1P10072 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HKR1P10072 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms