Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIMD1P0DJR0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 309.7 ms