Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
HOXB7P09629 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXB7P09629 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms