Protein–RNA interactions for Protein: P08651

NFIC, Nuclear factor 1 C-type, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFICP08651 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFICP08651 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFICP08651 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFICP08651 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFICP08651 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFICP08651 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NFICP08651 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFICP08651 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFICP08651 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFICP08651 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFICP08651 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFICP08651 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFICP08651 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFICP08651 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFICP08651 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFICP08651 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NFICP08651 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFICP08651 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFICP08651 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFICP08651 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFICP08651 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFICP08651 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFICP08651 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFICP08651 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFICP08651 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFICP08651 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFICP08651 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFICP08651 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFICP08651 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFICP08651 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFICP08651 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFICP08651 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFICP08651 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFICP08651 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFICP08651 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFICP08651 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFICP08651 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFICP08651 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFICP08651 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFICP08651 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFICP08651 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFICP08651 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFICP08651 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFICP08651 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFICP08651 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFICP08651 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFICP08651 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFICP08651 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFICP08651 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFICP08651 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFICP08651 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFICP08651 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFICP08651 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFICP08651 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFICP08651 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFICP08651 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFICP08651 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFICP08651 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFICP08651 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFICP08651 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFICP08651 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFICP08651 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFICP08651 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NFICP08651 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFICP08651 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFICP08651 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFICP08651 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFICP08651 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NFICP08651 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFICP08651 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFICP08651 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFICP08651 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFICP08651 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFICP08651 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFICP08651 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFICP08651 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFICP08651 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFICP08651 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFICP08651 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFICP08651 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFICP08651 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFICP08651 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFICP08651 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFICP08651 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFICP08651 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFICP08651 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFICP08651 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFICP08651 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFICP08651 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFICP08651 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFICP08651 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFICP08651 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFICP08651 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFICP08651 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFICP08651 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFICP08651 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFICP08651 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFICP08651 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFICP08651 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFICP08651 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms