Protein–RNA interactions for Protein: P08253

MMP2, 72 kDa type IV collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP2P08253 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP2P08253 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP2P08253 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP2P08253 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP2P08253 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP2P08253 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP2P08253 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP2P08253 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP2P08253 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP2P08253 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP2P08253 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP2P08253 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP2P08253 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP2P08253 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP2P08253 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP2P08253 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP2P08253 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP2P08253 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP2P08253 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP2P08253 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP2P08253 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP2P08253 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP2P08253 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP2P08253 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP2P08253 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP2P08253 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP2P08253 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP2P08253 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP2P08253 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP2P08253 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP2P08253 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP2P08253 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP2P08253 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP2P08253 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP2P08253 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP2P08253 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP2P08253 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP2P08253 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP2P08253 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP2P08253 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP2P08253 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP2P08253 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP2P08253 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP2P08253 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP2P08253 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP2P08253 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP2P08253 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP2P08253 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP2P08253 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP2P08253 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP2P08253 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP2P08253 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP2P08253 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP2P08253 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP2P08253 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP2P08253 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP2P08253 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP2P08253 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP2P08253 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP2P08253 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP2P08253 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP2P08253 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP2P08253 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP2P08253 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP2P08253 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP2P08253 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP2P08253 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP2P08253 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP2P08253 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP2P08253 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP2P08253 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP2P08253 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP2P08253 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP2P08253 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP2P08253 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP2P08253 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP2P08253 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP2P08253 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP2P08253 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP2P08253 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMP2P08253 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMP2P08253 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMP2P08253 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP2P08253 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP2P08253 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP2P08253 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP2P08253 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP2P08253 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP2P08253 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP2P08253 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP2P08253 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP2P08253 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP2P08253 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP2P08253 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP2P08253 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP2P08253 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP2P08253 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP2P08253 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP2P08253 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP2P08253 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms