Protein–RNA interactions for Protein: P08237

PFKM, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKMP08237 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKMP08237 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKMP08237 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKMP08237 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKMP08237 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKMP08237 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKMP08237 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKMP08237 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKMP08237 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKMP08237 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKMP08237 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKMP08237 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKMP08237 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKMP08237 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PFKMP08237 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PFKMP08237 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PFKMP08237 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PFKMP08237 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PFKMP08237 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PFKMP08237 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PFKMP08237 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PFKMP08237 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PFKMP08237 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PFKMP08237 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PFKMP08237 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PFKMP08237 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PFKMP08237 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PFKMP08237 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PFKMP08237 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PFKMP08237 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PFKMP08237 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PFKMP08237 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PFKMP08237 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PFKMP08237 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PFKMP08237 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PFKMP08237 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PFKMP08237 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PFKMP08237 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PFKMP08237 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFKMP08237 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFKMP08237 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFKMP08237 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFKMP08237 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFKMP08237 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PFKMP08237 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFKMP08237 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFKMP08237 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFKMP08237 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFKMP08237 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFKMP08237 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFKMP08237 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFKMP08237 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFKMP08237 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFKMP08237 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFKMP08237 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFKMP08237 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFKMP08237 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFKMP08237 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PFKMP08237 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PFKMP08237 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PFKMP08237 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PFKMP08237 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PFKMP08237 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PFKMP08237 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PFKMP08237 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PFKMP08237 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PFKMP08237 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PFKMP08237 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PFKMP08237 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PFKMP08237 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PFKMP08237 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PFKMP08237 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PFKMP08237 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PFKMP08237 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PFKMP08237 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PFKMP08237 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PFKMP08237 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PFKMP08237 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PFKMP08237 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PFKMP08237 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PFKMP08237 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PFKMP08237 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PFKMP08237 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PFKMP08237 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PFKMP08237 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PFKMP08237 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PFKMP08237 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PFKMP08237 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PFKMP08237 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PFKMP08237 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PFKMP08237 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PFKMP08237 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PFKMP08237 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PFKMP08237 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PFKMP08237 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PFKMP08237 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PFKMP08237 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PFKMP08237 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PFKMP08237 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PFKMP08237 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms