Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT6BP04259 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT6BP04259 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms