Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX7O95931 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX7O95931 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX7O95931 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX7O95931 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX7O95931 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX7O95931 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX7O95931 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX7O95931 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX7O95931 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX7O95931 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX7O95931 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX7O95931 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX7O95931 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX7O95931 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX7O95931 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX7O95931 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX7O95931 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX7O95931 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX7O95931 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX7O95931 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX7O95931 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX7O95931 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX7O95931 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX7O95931 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX7O95931 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX7O95931 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX7O95931 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX7O95931 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX7O95931 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX7O95931 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX7O95931 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX7O95931 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX7O95931 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX7O95931 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX7O95931 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX7O95931 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX7O95931 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX7O95931 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX7O95931 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX7O95931 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX7O95931 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX7O95931 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX7O95931 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX7O95931 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX7O95931 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX7O95931 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX7O95931 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX7O95931 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX7O95931 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX7O95931 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX7O95931 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX7O95931 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX7O95931 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX7O95931 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX7O95931 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX7O95931 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX7O95931 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX7O95931 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX7O95931 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX7O95931 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX7O95931 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX7O95931 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX7O95931 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX7O95931 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX7O95931 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX7O95931 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX7O95931 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX7O95931 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX7O95931 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX7O95931 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX7O95931 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX7O95931 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX7O95931 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX7O95931 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX7O95931 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX7O95931 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX7O95931 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX7O95931 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX7O95931 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX7O95931 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBX7O95931 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX7O95931 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX7O95931 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX7O95931 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX7O95931 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX7O95931 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX7O95931 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX7O95931 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX7O95931 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX7O95931 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX7O95931 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX7O95931 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX7O95931 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX7O95931 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX7O95931 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBX7O95931 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX7O95931 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX7O95931 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX7O95931 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms