Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSL3O95573 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms