Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF6BO95407 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF6BO95407 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF6BO95407 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF6BO95407 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF6BO95407 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF6BO95407 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF6BO95407 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF6BO95407 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF6BO95407 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF6BO95407 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF6BO95407 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF6BO95407 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF6BO95407 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF6BO95407 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF6BO95407 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF6BO95407 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF6BO95407 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF6BO95407 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF6BO95407 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF6BO95407 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF6BO95407 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF6BO95407 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF6BO95407 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms