Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG7O95352 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG7O95352 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG7O95352 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG7O95352 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG7O95352 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG7O95352 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG7O95352 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG7O95352 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG7O95352 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG7O95352 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG7O95352 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG7O95352 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG7O95352 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG7O95352 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG7O95352 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG7O95352 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG7O95352 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG7O95352 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG7O95352 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG7O95352 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG7O95352 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG7O95352 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG7O95352 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG7O95352 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG7O95352 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG7O95352 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG7O95352 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG7O95352 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG7O95352 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG7O95352 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG7O95352 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG7O95352 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG7O95352 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG7O95352 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG7O95352 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG7O95352 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG7O95352 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG7O95352 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG7O95352 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG7O95352 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG7O95352 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG7O95352 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG7O95352 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG7O95352 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG7O95352 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG7O95352 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG7O95352 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG7O95352 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG7O95352 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG7O95352 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG7O95352 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG7O95352 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG7O95352 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG7O95352 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG7O95352 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG7O95352 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG7O95352 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG7O95352 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG7O95352 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG7O95352 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG7O95352 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG7O95352 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATG7O95352 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATG7O95352 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG7O95352 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG7O95352 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG7O95352 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG7O95352 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG7O95352 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG7O95352 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG7O95352 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG7O95352 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG7O95352 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG7O95352 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG7O95352 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG7O95352 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG7O95352 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG7O95352 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG7O95352 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG7O95352 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG7O95352 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG7O95352 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG7O95352 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG7O95352 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG7O95352 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG7O95352 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG7O95352 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG7O95352 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG7O95352 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG7O95352 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG7O95352 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG7O95352 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG7O95352 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG7O95352 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG7O95352 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG7O95352 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG7O95352 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG7O95352 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG7O95352 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms