Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNUPNO95149 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNUPNO95149 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms