Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG12O94817 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATG12O94817 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATG12O94817 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATG12O94817 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG12O94817 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG12O94817 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG12O94817 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG12O94817 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG12O94817 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG12O94817 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG12O94817 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG12O94817 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG12O94817 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG12O94817 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG12O94817 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG12O94817 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG12O94817 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG12O94817 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG12O94817 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG12O94817 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG12O94817 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG12O94817 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG12O94817 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG12O94817 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG12O94817 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG12O94817 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG12O94817 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG12O94817 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG12O94817 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG12O94817 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG12O94817 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG12O94817 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG12O94817 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG12O94817 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG12O94817 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG12O94817 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG12O94817 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG12O94817 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG12O94817 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG12O94817 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG12O94817 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG12O94817 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG12O94817 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG12O94817 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG12O94817 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG12O94817 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG12O94817 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG12O94817 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG12O94817 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG12O94817 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG12O94817 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG12O94817 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG12O94817 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG12O94817 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG12O94817 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG12O94817 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG12O94817 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG12O94817 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG12O94817 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG12O94817 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG12O94817 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG12O94817 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG12O94817 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG12O94817 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG12O94817 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG12O94817 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG12O94817 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG12O94817 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG12O94817 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG12O94817 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG12O94817 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG12O94817 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG12O94817 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG12O94817 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG12O94817 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG12O94817 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG12O94817 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG12O94817 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG12O94817 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG12O94817 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG12O94817 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG12O94817 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG12O94817 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG12O94817 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG12O94817 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG12O94817 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG12O94817 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG12O94817 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG12O94817 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG12O94817 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG12O94817 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG12O94817 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG12O94817 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG12O94817 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG12O94817 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG12O94817 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG12O94817 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG12O94817 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG12O94817 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms