Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIOO75962 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIOO75962 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIOO75962 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIOO75962 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIOO75962 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIOO75962 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIOO75962 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIOO75962 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIOO75962 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIOO75962 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIOO75962 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIOO75962 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIOO75962 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIOO75962 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIOO75962 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIOO75962 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIOO75962 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIOO75962 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIOO75962 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIOO75962 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIOO75962 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIOO75962 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIOO75962 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIOO75962 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIOO75962 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIOO75962 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIOO75962 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIOO75962 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIOO75962 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIOO75962 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIOO75962 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIOO75962 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIOO75962 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIOO75962 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIOO75962 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIOO75962 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIOO75962 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIOO75962 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIOO75962 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIOO75962 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIOO75962 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIOO75962 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIOO75962 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIOO75962 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIOO75962 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIOO75962 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIOO75962 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIOO75962 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIOO75962 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIOO75962 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIOO75962 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIOO75962 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIOO75962 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIOO75962 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIOO75962 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIOO75962 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIOO75962 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIOO75962 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIOO75962 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOO75962 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOO75962 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOO75962 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOO75962 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOO75962 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOO75962 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOO75962 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOO75962 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOO75962 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOO75962 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOO75962 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOO75962 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOO75962 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOO75962 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOO75962 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIOO75962 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIOO75962 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIOO75962 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIOO75962 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIOO75962 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIOO75962 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIOO75962 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIOO75962 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIOO75962 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIOO75962 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOO75962 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOO75962 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOO75962 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOO75962 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOO75962 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOO75962 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOO75962 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOO75962 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOO75962 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOO75962 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOO75962 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOO75962 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOO75962 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOO75962 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOO75962 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms