Protein–RNA interactions for Protein: O75677

RFPL1, Ret finger protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL1O75677 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL1O75677 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL1O75677 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL1O75677 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL1O75677 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL1O75677 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL1O75677 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL1O75677 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL1O75677 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL1O75677 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL1O75677 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL1O75677 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL1O75677 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL1O75677 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL1O75677 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL1O75677 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL1O75677 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL1O75677 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL1O75677 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL1O75677 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL1O75677 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL1O75677 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL1O75677 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL1O75677 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL1O75677 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RFPL1O75677 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFPL1O75677 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFPL1O75677 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms