Protein–RNA interactions for Protein: O75436

VPS26A, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26AO75436 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS26AO75436 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms