Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP12O75317 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP12O75317 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP12O75317 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP12O75317 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP12O75317 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP12O75317 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP12O75317 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP12O75317 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP12O75317 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP12O75317 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP12O75317 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP12O75317 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP12O75317 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP12O75317 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP12O75317 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP12O75317 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP12O75317 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP12O75317 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP12O75317 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP12O75317 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP12O75317 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP12O75317 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP12O75317 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP12O75317 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP12O75317 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP12O75317 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP12O75317 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP12O75317 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP12O75317 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP12O75317 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP12O75317 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP12O75317 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP12O75317 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP12O75317 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP12O75317 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP12O75317 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP12O75317 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP12O75317 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP12O75317 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP12O75317 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP12O75317 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP12O75317 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP12O75317 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP12O75317 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP12O75317 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP12O75317 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP12O75317 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP12O75317 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP12O75317 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP12O75317 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP12O75317 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP12O75317 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP12O75317 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP12O75317 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP12O75317 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP12O75317 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP12O75317 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP12O75317 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP12O75317 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP12O75317 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP12O75317 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP12O75317 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP12O75317 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP12O75317 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP12O75317 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP12O75317 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP12O75317 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP12O75317 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP12O75317 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP12O75317 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP12O75317 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP12O75317 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP12O75317 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP12O75317 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP12O75317 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP12O75317 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP12O75317 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP12O75317 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP12O75317 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP12O75317 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP12O75317 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP12O75317 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP12O75317 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP12O75317 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP12O75317 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP12O75317 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP12O75317 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP12O75317 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP12O75317 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP12O75317 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP12O75317 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP12O75317 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP12O75317 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP12O75317 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP12O75317 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP12O75317 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP12O75317 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP12O75317 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP12O75317 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms